治疗乙肝的药物主要有核苷（酸）类似物和干扰素类。目前临床常用的核苷（酸）类似物有恩替卡韦等，它能抑制乙肝病毒复制，一般长期服用，价格方面，恩替卡韦一盒（通常7片）价格大概在20~30元左右。
核苷（酸）类似物类
恩替卡韦： 属于鸟嘌呤核苷类似物，通过磷酸化成为具有活性的三磷酸恩替卡韦，三磷酸恩替卡韦与天然底物三磷酸脱氧鸟嘌呤核苷竞争，抑制病毒多聚酶（逆转录酶）的所有三种活性：①HBV多聚酶的启动；②前基因组mRNA逆转录负链的合成；③HBV DNA正链的合成。替诺福韦酯： 是一种新型核苷酸类逆转录酶抑制剂。可有效对抗多种病毒，用于治疗病毒性感染性疾病。它能够抑制乙肝病毒复制，降低体内病毒载量。
干扰素类
普通干扰素： 具有抗病毒、免疫调节等作用。通过与细胞表面的干扰素受体结合，触发细胞内信号转导途径，诱导抗病毒蛋白的合成，从而抑制病毒复制。一般需要皮下注射，每周注射3次左右。聚乙二醇干扰素： 是普通干扰素与聚乙二醇结合而成，药物作用时间延长，每周注射1次即可。它除了具有抗病毒作用外，还能调节机体的免疫系统，可能对乙肝病毒的清除有更好的效果，但相对副作用可能较普通干扰素稍大一些，比如可能引起发热、乏力等不良反应。
其他相关药物
复方鳖甲软肝片： 这是一种中成药，具有软坚散结、化瘀解毒、益气养血的作用，可用于慢性乙型肝炎肝纤维化，以及早期肝硬化属瘀血阻络、气血亏虚兼热毒未尽证。不过它是辅助治疗药物，不能直接杀灭乙肝病毒。安络化纤丸： 也为中成药，能健脾养肝、凉血活血、软坚散结，用于慢性乙型肝炎、乙肝后早、中期肝硬化，表现为肝脾两虚、瘀热互结症候者，症见胁肋疼痛、脘腹胀满、神疲乏力、口干咽燥、纳食减少、便溏不爽、小便黄等。同样是辅助改善肝脏相关症状的药物。