阴茎上起疙瘩的原因有很多，以下是一些可能的原因：
1.阴茎珍珠疹：这是一种常见的良性病变，表现为阴茎冠状沟处的珍珠状、半透明丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等因素有关。通常没有明显症状，也不会传染，不需要特殊治疗。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。尖锐湿疣通常表现为外生殖器或肛门周围的疣状赘生物，可逐渐增大、增多。确诊后需要及时就医，进行抗病毒治疗、物理治疗或手术治疗。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。传染性软疣表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。治疗主要是刮除疣体，或使用冷冻、激光等方法。
4.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。生殖器疱疹初起时为红斑或丘疹，很快形成水疱，疱液澄清，自觉灼痒或疼痛。水疱可破溃形成糜烂或溃疡，病程约2~3周。生殖器疱疹容易复发，需要长期抗病毒治疗。
5.梅毒：由梅毒螺旋体感染引起，主要通过性接触传播。梅毒一期表现为外生殖器硬下疳，二期表现为梅毒疹，三期可出现皮肤、黏膜、骨骼、心血管等多系统损害。确诊后需要及时就医，进行驱梅治疗。
6.其他：阴茎上起疙瘩还可能与过敏、感染、肿瘤等因素有关。
如果发现阴茎上起疙瘩，建议及时就医，明确诊断，并根据具体情况进行相应的治疗。同时，要注意保持局部清洁卫生，避免搔抓和摩擦，避免不洁性生活。