长期使用呼吸机可能会有一些坏处，具体包括：
1.呼吸机相关性肺炎：由于使用呼吸机时，患者的呼吸道与外界相通，容易导致细菌感染，引起肺炎。
2.气压伤：使用呼吸机时，气道内会产生正压，如果压力过高，可能会导致肺泡破裂，引起气胸等气压伤。
3.其他并发症：长期使用呼吸机还可能会导致呼吸机依赖、皮肤损伤、幽闭恐惧症等并发症。
需要注意的是，这些坏处并不是一定会发生的，医生会根据患者的具体情况进行调整和监测，以减少并发症的发生风险。同时，患者在使用呼吸机期间也需要注意个人卫生，如勤漱口、翻身等，以预防并发症的发生。如果出现不适，应及时告知医生。