肛门总是擦不干净，可能是由以下原因引起的：
1.肛肠疾病：
痔疮：内痔或混合痔通常不会痛，也不会痒，但可能会导致肛门分泌物增多，使肛门总是擦不干净。
肛瘘：肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，可反复自外口流出脓液，常伴有瘙痒。
肛裂：肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
2.肠道疾病：
炎症性肠病：包括溃疡性结肠炎和克罗恩病，可导致肠道炎症和分泌物增多，引起肛门不适。
肠道感染：如痢疾、肠炎等，可引起肠道炎症和腹泻，导致肛门擦不干净。
肠道肿瘤：如直肠癌、结肠癌等，可导致肠道狭窄、排便习惯改变和肛门分泌物增多。
当出现肛门总是擦不干净的情况时，建议及时就医，进行详细的检查，如肛门指诊、结肠镜等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，保持肛门清洁、避免久坐、饮食清淡等也有助于缓解症状。