甲硝唑片是常用的抗厌氧菌、抗滴虫药物，但使用时可能出现一些副作用。一般来说，其常见副作用主要体现在以下几方面。
胃肠道方面的副作用
恶心呕吐： 大约有15% - 30%的人在服用甲硝唑片后会出现恶心的症状，有些较严重的还可能伴随呕吐。比如部分人服药后很快就感觉胃部不适，进而出现呕吐现象，影响食欲。食欲不振： 服用甲硝唑片后，有些人会明显感觉胃口变差，不想吃东西，持续时间因人而异，短则一两天，长则可能一周左右。
神经系统方面的副作用
头痛： 约有5% - 10%的人服用甲硝唑片后会出现头痛症状，一般程度较轻，但也有少数人头痛比较明显。比如有些人会感觉头部隐隐作痛，影响日常活动。眩晕： 个别人服用后会有眩晕感，走路时可能会觉得不稳，尤其是在刚开始服药或者剂量稍大时更容易出现。
其他方面的副作用
口腔异味： 部分人服药后会出现口腔异味，感觉嘴里有特殊的味道，这可能会让患者比较困扰。白细胞减少： 虽然比较少见，但个别情况下服用甲硝唑片可能会导致白细胞减少，不过一般停药后可恢复。比如有的患者在服药后检查血常规发现白细胞数值较之前降低，经过医生评估后调整用药。过敏反应： 极少数人可能对甲硝唑片过敏，出现皮疹、瘙痒等症状，严重的可能会有呼吸困难等过敏休克表现，但这种情况发生概率极低。