头疼的原因有很多，以下是一些可能的原因：
1.感染：病毒、细菌、真菌等感染都可能引起头疼，如感冒、脑膜炎等。
2.神经系统问题：如偏头痛、三叉神经痛、脑炎等。
3.头部外伤：如脑震荡、颅骨骨折等。
4.代谢问题：低血糖、低钠血症、酸中毒等。
5.药物副作用：某些药物可能会引起头疼，如降压药、抗抑郁药等。
6.其他：如颈椎病、青光眼、丛集性头痛等。
体温为$35.5^{\circ}C$属于体温过低，可能与个人的基础体温有关，也可能是由于外界环境温度过低、测量误差等原因引起。
如果头疼同时伴有体温过低，建议及时就医，进行详细的检查，以确定病因并进行相应的治疗。同时，要注意保暖，多喝热水，适当休息。