脑梗死后遗症出现腿疼可能是因为脑梗死的部位在丘脑，所以会出现对侧肢体的感觉麻木、疼痛。一般的丘脑引起的疼痛在恢复期治疗比较难，可以考虑中医中药的办法，可以给予患者患侧肢体，进行针灸、按摩、中频脉冲电治疗、中药离子导入等方式进行治疗，但是一般效果都不会太理想。
另外，后遗症侧的腿疼也可以是因为恢复不及时，下肢的肌张力增高导致的，可以对症口服降低肌张力的药物，比如替扎尼定片，腿疼可以缓解。
还需要考虑到是否因为活动不足、总不晒太阳导致缺钙等原因引起腿疼，可以对症给予补钙治疗，腿疼的症状也可以有改善。