怀孕两个月只有胎囊没有胎芽，可能是以下原因导致的。
1.月经周期不规律：如果女性的月经周期较长，受孕时间较晚，可能会导致胎芽出现的时间较晚。
2.胚胎发育异常：如果胚胎本身存在染色体异常或其他发育问题，可能会导致胎芽无法正常形成。
3.胎停育：如果胎囊已经停止发育，但还没有自然排出体外，也会出现只有胎囊没有胎芽的情况。
4.其他因素：孕妇患有全身性疾病、内分泌失调、子宫畸形、免疫因素等，也可能影响胚胎的发育。
需要注意的是，每个女性的情况都不同，如果在怀孕两个月时只有胎囊没有胎芽，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案，如等待观察、药物治疗或清宫手术等。
在等待诊断和治疗的过程中，孕妇应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。同时，保持良好的心态，积极配合医生的治疗。如果确诊为胎停育，应及时进行清宫手术，以避免对孕妇的身体造成更大的伤害。
此外，对于有过胎停育史的女性，再次怀孕前应进行全面的检查，包括染色体检查、内分泌检查、子宫检查等，以排除潜在的问题。同时，在怀孕期间应注意休息，保持良好的生活习惯，避免接触有害物质，按照医生的建议进行产前检查和保健。
总之，怀孕两个月只有胎囊没有胎芽是一种异常情况，需要引起重视。及时就医，进行详细的检查和诊断，采取相应的治疗措施，有助于保护孕妇的身体健康和胚胎的正常发育。