治疗毛囊炎最有效的药需要根据具体病情来选择，以下是一些常用的药物：
1.抗生素：如外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏，或口服头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊等。对于细菌感染引起的毛囊炎，抗生素可以有效控制炎症。
2.抗真菌药物：如外用酮康唑乳膏、克霉唑乳膏，或口服伊曲康唑胶囊、氟康唑片等。对于真菌感染引起的毛囊炎，抗真菌药物是首选。
3.角质促成剂：如5%的水杨酸软膏、10%的硫磺软膏等。这类药物可以促进角质层的正常角化，减少毛囊堵塞，从而缓解毛囊炎的症状。
4.系统用维A酸类药物：如异维A酸软胶囊。该药物可以调节毛囊皮脂腺的角化异常，减少皮脂分泌，对痤疮丙酸杆菌有抑制作用，适用于严重的毛囊炎患者。
需要注意的是，使用药物治疗毛囊炎时，应遵循医生的建议，按照说明书的用法用量使用。同时，要注意个人卫生，保持皮肤清洁，避免搔抓和挤压患处，以免加重病情。此外，如果毛囊炎症状严重或持续不愈，应及时就医，以便调整治疗方案。
对于特殊人群，如孕妇和哺乳期妇女，在使用药物治疗毛囊炎时应格外谨慎。应在医生的指导下选择对胎儿和婴儿相对安全的药物，并严格按照医嘱使用。
总之，治疗毛囊炎最有效的药因人而异，需要根据具体病情和个体情况来选择。在使用药物治疗的同时，还应注意个人卫生和生活习惯，以促进病情的恢复。