安眠药可能会带来一些副作用，比如常见的有次日困倦，大约有30% - 50%服用安眠药的人会在服药后的第二天感到困倦、乏力，影响日常的工作和学习。
神经系统方面的副作用
头晕头痛： 部分人服用安眠药后会出现头晕的情况，严重的可能伴有头痛。这是因为安眠药会影响神经系统的平衡和调节，一般短时间内可逐渐缓解，但如果持续不缓解或加重，就需要就医调整用药。记忆力减退： 长期使用某些安眠药可能会对记忆力产生影响，尤其是老年人相对更敏感。有研究发现，长期服用苯二氮䓬类安眠药超过3个月的人群，约有10% - 15%会出现不同程度的记忆力下降，表现为对近期发生的事情遗忘较快。
消化系统方面的副作用
恶心呕吐： 一些人服用安眠药后会刺激胃肠道，出现恶心的症状，严重时可能引发呕吐。比如服用巴比妥类安眠药的患者中，约有5% - 8%会出现恶心呕吐的情况，尤其是在空腹服药时更容易发生。食欲减退： 安眠药可能会影响消化系统的功能，导致服药者食欲下降。长期食欲减退可能会引起营养摄入不足，需要注意通过调整饮食来补充营养，如果食欲长时间未见改善，应咨询医生是否需要调整安眠药的使用。
呼吸方面的副作用
呼吸抑制： 对于本身有呼吸系统疾病的人，如慢性阻塞性肺疾病患者，服用安眠药可能会加重呼吸抑制。在睡眠状态下，正常的呼吸调节可能会受到安眠药的干扰，使得呼吸频率减慢、深度变浅，严重时可能危及生命。特别是使用苯二氮䓬类强效安眠药时，这种风险相对更高。打鼾加重： 部分原本就有打鼾问题的人，服用安眠药后可能会使打鼾情况加重。这是因为安眠药抑制了中枢神经系统，导致上气道肌肉松弛程度增加，进一步加重气道狭窄，使打鼾声音更响，甚至可能出现呼吸暂停的情况。