大便后肛门痛可能由多种原因引起。
一、肛裂导致的肛门痛
肛裂是常见原因之一，通常是由于大便干结，排便时撑裂肛管皮肤，引起肛门痛，多为刀割样或烧灼样疼痛，排便后疼痛可暂缓解，但随后因括约肌痉挛又出现长时间剧痛。肛裂好发于青壮年及儿童，与大便干燥、排便用力等因素相关。
二、痔疮引发的肛门痛
内痔脱出嵌顿或外痔发生血栓时，会出现肛门痛。内痔脱出不能回纳，局部血液循环障碍，肿胀疼痛；外痔形成血栓，表现为肛门突发肿物，疼痛较剧烈，尤其在排便、行走等情况下加重。痔疮的发生与久坐、便秘、妊娠等因素有关，各年龄段均可发病。
三、肛周脓肿造成的肛门痛
肛周脓肿是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，疼痛较为剧烈，呈持续性胀痛，逐渐加重，病变处有红肿、压痛，可伴有发热等全身症状。多见于20 - 40岁的青壮年，常因肛腺感染等引起。
四、肛窦炎引起的肛门痛
肛窦炎是肛窦、肛门瓣发生的急慢性炎症，排便时粪便刺激发炎的肛窦，导致肛门部灼痛，可伴有少量黏液便排出。各年龄段均可发病，与肛门局部卫生不良、腹泻等因素有关。