治疗脑神经衰弱的方法主要包括物理疗法、针灸治疗和药物治疗。物理疗法主要是嘱咐患者平时要放松心情，减轻压力，适当参加体育锻炼，多进行户外运动，要养成良好的生活习惯，按时睡眠起床，不熬夜，避免睡前喝浓茶、咖啡，避免睡前过度兴奋，也可以在睡前用热水泡脚，听缓和的音乐，喝一杯热牛奶，可以在睡前进行有氧运动，包括出去散散步、练练太极剑、打打太极拳等等。
药物治疗主要是口服谷维素、安神补脑液、养血清脑颗粒、心神宁片和酸枣仁口服液。如果患者睡眠障碍严重时也可以用镇静药物常用的有劳拉西泮、地西泮、艾司唑仑和阿普唑仑。