怀孕5个月时出现小肚子疼痛，可能是以下原因引起。
1.子宫增大：怀孕5个月时，子宫迅速增大，可能会牵拉子宫周围的韧带，引起小肚子疼痛。这种疼痛通常是轻微的，呈间歇性，休息后可以缓解。
2.宫缩：如果小肚子疼痛同时伴有肚子发硬，可能是宫缩引起的。宫缩分为生理性宫缩和病理性宫缩，生理性宫缩一般没有明显的疼痛，不会引起宫颈管缩短和宫口扩张，对胎儿没有影响；病理性宫缩可能会导致早产、胎膜早破等不良后果，需要及时就医。
3.其他原因：
先兆流产：除了小肚子疼痛，还可能伴有阴道流血、腰痛等症状。
胎盘早剥：小肚子疼痛剧烈，伴有阴道流血，可能是胎盘早剥引起的，需要立即就医。
胃肠道疾病：如果小肚子疼痛同时伴有恶心、呕吐、腹泻等症状，可能是胃肠道疾病引起的。
泌尿系统疾病：如果小肚子疼痛同时伴有尿频、尿急、尿痛等症状，可能是泌尿系统疾病引起的。
总之，怀孕5个月时出现小肚子疼痛，需要及时就医，明确原因，以便采取相应的治疗措施。同时，孕妇要注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉快。如果疼痛加重或伴有其他不适症状，应立即就医。