耳根一阵一阵疼，可能与以下原因有关。
1.耳部疾病：
外耳道炎：外耳道皮肤损伤或感染，可引起外耳道肿胀、疼痛，疼痛可放射至耳根。
中耳炎：中耳腔发生炎症，可导致耳痛，疼痛可波及耳根。
鼓膜穿孔：鼓膜穿孔后，中耳内的脓液可能会刺激外耳道，引起疼痛。
2.耳部神经痛：
三叉神经痛：三叉神经分布区域的疼痛，可表现为耳根疼痛。
舌咽神经痛：舌咽神经分布区域的疼痛，也可引起耳根疼痛。
3.其他原因：
颈部疾病：颈椎病、颈部肌肉劳损等颈部疾病，可刺激或压迫颈部神经，引起耳根疼痛。
感染：上呼吸道感染、流感等感染性疾病，可引起耳部疼痛。
外伤：耳部外伤、挫伤等，可导致耳根疼痛。
颞下颌关节紊乱：颞下颌关节功能紊乱，可引起耳部疼痛。
如果耳根疼痛持续时间较长、疼痛剧烈、伴有听力下降、耳鸣等症状，建议及时就医，进行相关检查，如耳部检查、血常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，在就医前应注意休息，避免耳部进水，避免食用辛辣刺激性食物。