月经第6天有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.黄体功能萎缩不全：黄体功能萎缩不全可能导致子宫内膜不规则脱落，使月经后期出血。这种情况通常发生在生育期女性，可能会影响受孕。如果偶尔出现这种情况，通常不需要治疗；如果经常出现，可能需要在医生的指导下使用孕激素类药物进行治疗。
2.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种常见的妇科疾病，可能导致月经间期出血、经量增多、经期延长等症状。较小的息肉通常没有明显症状，较大的息肉可能会引起上述异常。B超检查有助于诊断，治疗方法通常为宫腔镜下息肉切除术。
3.子宫内膜炎：子宫内膜炎是子宫内膜的炎症，可能导致月经异常、下腹疼痛等症状。如果是急性子宫内膜炎，还可能伴有发热等全身症状。治疗方法主要是使用抗生素进行抗感染治疗。
4.其他：宫内节育器、排卵期出血、宫颈癌、子宫内膜癌等也可能导致类似症状。
需要注意的是，褐色分泌物也可能是其他疾病的表现，如果经常出现这种情况，或者伴有其他异常症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。此外，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适量运动等，有助于维持月经的正常。