一年内吃三次紧急避孕药的危害主要有以下几点：
1.内分泌失调：紧急避孕药属于孕激素类药物，一年内多次服用可能会导致内分泌失调，引起激素水平紊乱，从而出现月经周期不规律、经量异常、面部痤疮等症状。
2.恶心呕吐：部分女性在服用紧急避孕药后会出现恶心、呕吐等胃肠道反应，这是药物的副作用之一。
3.不规则阴道出血：服用紧急避孕药后，可能会出现不规则阴道出血，这是由于药物导致的子宫内膜脱落引起的。
4.月经紊乱：紧急避孕药会影响卵巢功能，导致月经周期紊乱，如月经提前、推迟或闭经等。
5.其他：长期频繁服用紧急避孕药还可能会增加心血管疾病、乳腺癌等疾病的发生风险。
需要注意的是，以上危害并非一定会发生，每个人的身体状况和反应都不同。此外，紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，只能在无保护措施的性生活后使用。为了减少药物的副作用和对身体的影响，建议在医生的指导下使用，并尽量避免频繁使用。同时，还应注意其他避孕方法，如避孕套、短效避孕药等，以保护自己的身体健康。