先天性心脏病孕检能查出来，但检出率会因胎儿的发育情况和心脏病的类型而有所不同。
具体如下：
1.大排畸检查：一般在孕20-24周进行，主要通过超声检查胎儿的心脏结构，如心房、心室、室间隔、大动脉等，以发现常见的先天性心脏病。但大排畸检查也有一定的局限性，如胎儿体位、心脏结构异常的严重程度等因素可能影响检查结果。
2.无创产前基因检测：可在孕12-26周进行，通过检测孕妇外周血中的胎儿游离DNA，分析胎儿患染色体疾病的风险。虽然不能直接诊断先天性心脏病，但可以作为一种辅助检查，发现一些与先天性心脏病相关的染色体异常。
3.胎儿超声心动图：如果大排畸检查发现胎儿心脏结构异常，或孕妇有其他高危因素，如家族性心脏病史、高龄产妇等，可能需要进行胎儿超声心动图检查。该检查能更详细地评估胎儿心脏的功能和结构，对先天性心脏病的诊断具有重要意义。
4.其他检查：医生还可能根据具体情况建议进行其他检查，如羊膜腔穿刺、绒毛活检等，以进一步明确胎儿是否存在染色体异常或其他遗传疾病。
需要注意的是，即使孕检发现胎儿可能患有先天性心脏病，也需要进一步的产前诊断和咨询，以了解疾病的严重程度和可能的影响。同时，孕妇和家人应保持理性和冷静，遵循医生的建议，进行后续的检查和治疗。
总之，先天性心脏病孕检能查出来，但检出率并非100%。孕妇应按时进行产前检查，密切配合医生的工作，以保障胎儿的健康。