肾结石患者一般可根据具体情况选择药物，如排石类药物、缓解疼痛类药物等。对于较小的肾结石，部分患者可通过药物辅助排出，通常每天饮水量需达到2000~3000毫升以上，帮助结石排出。
排石类药物
枸橼酸氢钾钠： 可以调节尿液pH值，使尿液呈碱性，降低尿液中钙离子浓度，从而防止新结石形成，并有助于溶解某些类型的肾结石，比如尿酸结石等。一般需要长期服用，具体服用时长需根据结石情况遵医嘱。坦索罗辛： 属于α受体阻滞剂，能松弛输尿管平滑肌，促进输尿管蠕动，有助于较小的肾结石向下移动，促进排出，通常成人一次服用0.2mg，每天一次。
缓解疼痛类药物
非甾体类抗炎药： 如双氯芬酸钠，能通过抑制前列腺素合成来减轻疼痛和炎症。一般口服双氯芬酸钠缓释片，一次50mg，一日1~2次。但有消化道溃疡等病史的患者要慎用，可能会加重消化道不适。阿片类镇痛药： 对于疼痛较剧烈的患者，可能会使用到，如哌替啶。但这类药物有成瘾性风险，一般在其他止痛药物效果不佳时才会考虑使用，且需严格遵循医嘱。
针对结石成分的药物
尿酸结石： 除了枸橼酸氢钾钠外，别嘌醇也可用于治疗。别嘌醇能抑制尿酸合成，减少尿酸生成，从而降低尿液中尿酸浓度，预防和治疗尿酸结石。成人常用量初始一次50mg，一日1~2次，每周可递增50~100mg，至一日200~300mg，分2~3次服。但肾功能不全者要调整剂量。胱氨酸结石： 青霉胺可用于治疗胱氨酸结石，它能与胱氨酸结合形成溶解度较高的化合物，促进其排出。但青霉胺可能会引起过敏反应等不良反应，用药前需做青霉素皮试，且用药过程中要密切监测血常规、尿常规等指标。