一般来说，正规医院的肠镜检查是相对安全的，不会发生交叉感染。因为正规医院会采取一系列严格的感染控制措施，来确保肠镜检查的安全性。
在进行肠镜检查前，医生会询问患者的病史，并进行一些必要的检查，以排除感染的可能。在检查过程中，医生会使用一次性的肠镜和器械，并严格按照消毒和灭菌的规范进行操作，以确保器械的卫生和安全。
此外，医院还会对肠镜检查室进行定期的清洁和消毒，以减少感染的风险。患者在进行肠镜检查后，也需要注意个人卫生，如勤洗手等，以避免感染的发生。
但是，如果医院的感染控制措施不到位，或者医生在操作过程中没有严格遵守规范，就有可能导致交叉感染的发生。因此，为了确保肠镜检查的安全，患者在选择医院时，一定要选择正规的医院，并在检查前了解医院的感染控制措施和医生的操作规范。
需要注意的是，对于一些特殊人群，如免疫功能低下的患者、患有传染病的患者等，进行肠镜检查时需要更加谨慎。这些患者可能更容易感染疾病，因此需要在医生的指导下进行检查，并采取相应的感染控制措施。
总之，肠镜检查一般不会发生交叉感染，但在一些特殊情况下，也需要注意感染的风险。患者在进行肠镜检查前，应了解医院的感染控制措施和医生的操作规范，并在检查后注意个人卫生，以确保自身的安全。如果对肠镜检查有任何疑问，可与医生进行充分的沟通。