上厕所时下体疼痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开所形成的小溃疡，肛裂引起的疼痛，呈周期性，多伴有便血。
2.外痔发炎：自觉肛门处有肿物，疼痛、肛门坠胀，排便后擦手纸时有少量鲜血。保守治疗同肛裂，形成肛瘘后需手术治疗。
3.肛管恶变：肛管部位有丰富的淋巴组织，任由病情发展，很容易出现溃破、感染，肛管恶变后，患者常出现肛门疼痛、下坠、脓血便、腹胀、消瘦、贫血等症状。
4.肛门脓肿或肛门异物：肛门周围脓肿应早期切开排脓，防止扩散形成肛瘘。肛门异物、肛管损伤、肛管直肠肿瘤均可引起肛门疼痛，需及时明确病因。
5.内痔嵌顿：多有疼痛、内痔脱出、便血等症状。
6.直肠炎：如果慢性结肠炎累及到直肠，可以出现肛门下坠感与排便次数增多。一般病程较长，反复发作，病变程度轻重不一。
7.肛窦炎：肛窦炎是引起肛门部下坠感的最常见原因。另外，肛窦与肛瓣发炎也叫肛隐窝炎，进一步可发展成肛周脓肿。
8.耻骨直肠肌综合征：耻骨直肠肌综合征是排便困难的一种，患者肛门处有疼痛，可在排便时加重或呈放射状，少数患者可有性交痛。肛管内括约肌痉挛、耻骨直肠肌肥厚、耻骨下坠感，是本征的主要特点。
需要注意的是，女性生殖系统与泌尿系统相邻，且女性尿道较短，宽而直，细菌容易上行感染，引起泌尿系统炎症，出现尿频、尿急、尿痛等症状，严重时也会出现排尿时下体疼痛。
如果出现上厕所时下体疼痛的症状，应及时就医，明确原因，以便进行针对性治疗。同时，在就医前应注意保持局部清洁，避免搔抓和摩擦，以免加重症状。此外，在饮食上应注意避免食用辛辣、刺激性食物，多喝水，保持大便通畅。