不能同时服用。健脑补肾丸和金匮肾气丸虽然都属于中成药，但由于两者的组成成分和功效存在差异，同时服用可能会影响药效或产生不良反应。
健脑补肾丸具有健脑补肾、益气健脾、安神定志的功效，主要用于治疗脾肾两虚引起的健忘、失眠、头晕目眩、耳鸣、腰膝酸软、遗精等症状。该药物含有肉桂、牛膝、山药等成分，其中肉桂和牛膝属于温热性药物，过量服用可能会引起上火、口干、咽痛等症状。
金匮肾气丸则具有温补肾阳、化气行水的功效，主要用于治疗肾阳不足引起的畏寒肢冷、腰膝酸软、小便不利或反多、痰饮喘咳等症状。该药物含有附子、肉桂、熟地等成分，其中附子和肉桂属于温热性药物，过量服用同样可能会引起上火、口干、咽痛等症状。
此外，健脑补肾丸和金匮肾气丸中都含有熟地成分，同时服用可能会导致药物成分过量，增加不良反应的发生风险。
因此，为了确保用药安全，建议在医生或药师的指导下选择合适的药物，并按照说明书的用法用量服用，避免同时服用两种或以上功效相似的中成药。同时，如果正在服用其他药物，也应提前告知医生或药师，以免发生药物相互作用。