黏液脓血便可见于多种肠道疾病，其中最常见的是细菌性痢疾，一般起病较急，患者会有发热、腹痛、腹泻，每天排便次数可达十余次甚至数十次，粪便多为黏液脓血便。
一、肠道感染性疾病
1. 细菌性痢疾：
由痢疾杆菌引起，除了有黏液脓血便外，还常伴有发热、腹痛、里急后重等症状。粪便镜检可见大量白细胞、红细胞和巨噬细胞。
2. 阿米巴痢疾：
是由溶组织内阿米巴感染所致，多为散发。患者腹痛相对较轻，粪便量较多，多呈暗红色果酱样，有特殊腥臭味，镜检可发现溶组织阿米巴滋养体。
二、炎症性肠病
1. 溃疡性结肠炎：
是一种慢性非特异性肠道炎症性疾病，病程较长，呈反复发作的慢性过程。主要症状为腹泻、黏液脓血便、腹痛，病情轻重不一，可伴有发热、营养不良等全身症状。内镜下可见结肠黏膜充血、水肿、糜烂及溃疡形成。
2. 克罗恩病：
也是一种慢性炎性肉芽肿性疾病，病变可累及胃肠道各部位，以末端回肠和邻近结肠多见。患者可有腹痛、腹泻、黏液脓血便，还可伴有发热、体重下降等表现，内镜下可见纵行溃疡、鹅卵石样改变等。
三、结直肠肿瘤
1. 结肠癌：
多见于中老年人，起病隐匿。早期可无明显症状，随着病情进展，可出现排便习惯改变、腹痛、黏液脓血便、腹部肿块等表现。粪便隐血试验常呈阳性，结肠镜检查及病理活检可明确诊断。
2. 直肠癌：
主要表现为便血、排便习惯改变，便血多为黏液脓血便，量一般较少，常伴有肛门坠胀感、里急后重等症状。直肠指检是诊断直肠癌的重要方法，多数可触及质硬、凹凸不平的肿块。