大便时肛门疼痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
治疗：可使用止痛栓剂、坐浴等方法缓解疼痛。同时，保持大便通畅非常重要，可以通过增加膳食纤维摄入、多喝水等方式改善。
药物：可使用利多卡因凝胶、硝酸甘油软膏等。
2.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，水肿、血栓形成，出现肛门疼痛。
治疗：可使用痔疮膏、栓剂等药物治疗。严重时可能需要手术治疗。
药物：如痔疮栓、痔疮膏等。
3.肛管炎：肛管部位受细菌感染引起的炎症，多由肛窦炎、肛乳头炎等疾病继发引起。
治疗：可使用抗生素控制感染，温水坐浴缓解疼痛。
药物：如甲硝唑、头孢呋辛酯等。
4.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿。
治疗：需要手术切开引流，并使用抗生素治疗。
药物：如头孢噻肟、左氧氟沙星等。
5.其他：肛门周围皮肤感染、直肠肿瘤等也可能导致肛门疼痛。
如果肛门疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、大便带血、肿块等，应及时就医，明确诊断并进行相应的治疗。同时，保持肛门局部清洁，避免久坐、久蹲，养成良好的排便习惯，对于预防肛门疼痛的发生也非常重要。