如果发现包皮上有小疙瘩，需要及时就医，由专业医生进行诊断和治疗。以下是一些可能的处理方法：
1.医生会根据具体情况进行检查，例如视诊、触诊等，以确定小疙瘩的性质、原因。
2.如果小疙瘩是由感染引起的，医生可能会开处方抗生素或抗真菌药物进行治疗。
3.对于尖锐湿疣等性传播疾病，医生可能会建议进行冷冻治疗、激光治疗或手术切除等。
4.如果小疙瘩是良性的，如皮脂腺囊肿或脂肪瘤，医生可能会建议观察或进行手术切除。
5.在治疗期间，患者需要注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓和摩擦，以免加重病情。
6.患者应遵循医生的建议进行治疗，并按时复诊，以便医生及时调整治疗方案。
需要注意的是，对于包皮上的小疙瘩，不能自行用药或采取不恰当的处理方法，以免延误病情。同时，如果患者有性伴侣，应同时进行检查和治疗，以避免交叉感染。