肉增生的去除方法需根据其类型等因素而定。对于一些较小的良性肉增生，可通过多种方式处理。
手术切除
对于明显突出皮肤的肉增生：手术切除是较为直接的方法。一般来说，在正规医院进行手术切除，费用因肉增生的部位、大小等不同而有所差异，通常小的肉增生切除费用可能在几百元到一千多元不等。但手术切除后要注意伤口护理，避免感染，保持伤口清洁干燥，一般7~10天左右伤口可愈合。
激光治疗
适用于多种肉增生：激光治疗肉增生是利用激光的高能量作用于肉增生组织，使其碳化或气化。例如对于一些色素性的肉增生或者较小的皮肤赘生物，激光治疗通常一次可能就能看到效果，但有时可能需要多次治疗。一般单次激光治疗的费用大概在几百元到数千元不等，具体取决于肉增生的情况。治疗后局部可能会有轻微红肿，一般1~2天可消退，要注意避免日晒，防止色素沉着。
冷冻治疗
针对特定肉增生：冷冻治疗是用低温的液氮作用于肉增生部位，使其坏死脱落。冷冻治疗相对比较经济，单次费用可能在几十元到几百元。治疗后局部会出现水疱等反应，要注意不要弄破水疱，让其自然吸收干涸，一般1~2周左右肉增生部位会脱落。不过冷冻治疗可能对于较大较厚的肉增生效果不太理想，需要多次治疗。
药物辅助（针对特定情况）
某些情况下可配合药物：比如对于一些因炎症刺激引起的肉增生，在进行物理治疗的同时，可能会辅助使用一些抗炎药物。但药物的使用需谨慎，要在医生指导下进行，不能自行随意用药。而且药物主要是起辅助作用，不能单纯依靠药物去除肉增生，还是要结合物理治疗等方法。同时，不同原因引起的肉增生在治疗上会有差异，比如因病毒感染引起的寻常疣导致的肉增生，治疗方式又有所不同，需要先明确肉增生的具体类型和病因，再选择合适的去除方法。