午睡起来头疼可能由多种原因引起。一般来说，可能与血压波动、颈部肌肉紧张或睡眠姿势不当等有关。比如，有研究发现，部分人午睡后血压波动可能导致头疼，大约有10% - 15%的人群会出现这种因血压变化引发午睡后头疼的情况。
一、血压波动导致
血压升高引发：午睡时身体处于放松状态，外周血管扩张，醒来后身体从休息状态快速转为活动状态，可能会引起血压突然升高，从而导致头疼。一般血压收缩压可能会比午睡之前升高20 - 30mmHg左右，就可能出现头疼症状。血压降低引发：另外，有些人午睡时间过长，超过30 - 60分钟，醒来后可能会出现血压偏低的情况，也会引起头疼，可能舒张压会降低10 - 20mmHg左右。
二、颈部肌肉紧张因素
睡眠姿势不当：如果午睡时趴着睡或者枕头高度不合适，会使颈部肌肉长时间处于紧张状态。比如趴着睡时，颈部弯曲角度不正常，肌肉持续牵拉，醒来后就容易出现头疼，这种情况在经常趴着午睡的人群中比较常见，大约占午睡后头疼人群的30%左右。肌肉劳损积累：长期颈部肌肉劳损的人，午睡时即使姿势相对正常，也可能因为颈部肌肉本身处于紧张疲劳状态，午睡后引发头疼。
三、脑部供血变化
脑部供血不足：午睡时人体代谢减慢，脑部血流速度相对较慢，醒来后如果脑部供血不能及时恢复到正常活动状态所需的水平，就可能出现头疼。一般脑部供血速度可能需要5 - 10分钟才能恢复到正常清醒活动时的状态，如果不能及时恢复，就容易引发头疼。脑部供血过多：相反，少数人午睡时脑部血流灌注过多，醒来后脑部血流突然变化，也会导致头疼，不过这种情况相对较少见。