HPV感染后，目前并没有针对HPV的特效治疗药物，主要依靠人体自身免疫力清除病毒，大约80%的女性一生中会有一次HPV感染，但通常在1-2年内可自行清除，只有持续高危型HPV感染才需要进一步处理。
一、自身免疫清除为主
人体免疫系统是清除HPV的关键，健康人群自身免疫力正常时，多数HPV感染属于一过性，无需特殊治疗，身体会依靠自身免疫功能将病毒清除，一般持续时间在1~2年左右。
二、针对病变的处理
1. 低级别病变处理
如果检查发现低级别鳞状上皮内病变，多数也能通过自身免疫清除病毒，但需要定期复查，一般建议每6-12个月进行一次宫颈细胞学（TCT）检查，观察病变是否有进展。
2. 高级别病变处理
当出现高级别鳞状上皮内病变时，需要进行干预。比如可以采用冷冻治疗，通过低温使病变组织坏死脱落；还可以进行激光治疗，利用激光的热能破坏病变组织。
三、辅助干预措施
1. 生活方式调整
保持良好的生活方式有助于增强免疫力，比如保证每天7~8小时的充足睡眠，合理饮食，多摄入富含维生素、蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果、瘦肉、鱼类等，还要适度运动，每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等。
2. 药物辅助
目前有一些辅助药物可以帮助增强免疫力，比如干扰素类药物，它可以调节机体免疫功能，起到一定的抗病毒作用，但使用这类药物需要在医生指导下进行，不能自行随意用药。