孕囊不规则是否会自行变好，取决于多种因素。以下是一些可能的情况：
1.孕囊形态异常可能是正常的：在怀孕早期，孕囊的形态可能会有所变化，有时可能看起来不规则。这种情况可能是由于孕囊还在发育过程中，或者由于测量的角度或技术原因导致的。在这种情况下，医生可能会建议进行进一步的超声检查，以确保孕囊的发育正常。
2.孕囊不规则可能与先兆流产有关：如果孕囊不规则同时伴有阴道出血、腹痛等症状，可能是先兆流产的迹象。在这种情况下，医生可能会建议采取卧床休息、使用孕激素等措施来保胎。如果症状加重或孕囊持续不规则，可能需要进行清宫手术。
3.孕囊不规则可能与其他问题有关：孕囊不规则还可能与其他问题有关，如染色体异常、子宫畸形、感染等。在这种情况下，医生可能会建议进行进一步的检查，如绒毛活检、羊水穿刺等，以确定胎儿的健康状况。如果存在严重的问题，可能需要终止妊娠。
4.个体差异：每个女性的身体状况和怀孕情况都是独特的，因此孕囊不规则的处理方式也会因人而异。医生会根据具体情况进行评估，并制定个性化的治疗方案。
需要注意的是，孕囊不规则并不一定意味着一定会出现问题，但需要密切关注和进一步的检查。如果对孕囊的情况有任何疑虑或担忧，应及时咨询医生，以便获得准确的诊断和建议。此外，在怀孕期间，保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适当休息、避免剧烈运动等，也有助于胎儿的健康发育。