扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤良性赘生物，治疗方法有多种，其中外用药物治疗是常用方式之一。比如0.05%~0.1%维A酸软膏，可调节细胞分化，但使用时要注意避免接触正常皮肤，一般需要连续使用数周才能见效。
外用药物治疗
维A酸类药物：像0.05%~0.1%维A酸软膏，能调节细胞分化，促使疣体脱落，但使用时要避开正常皮肤，通常需连续用数周才有效果。氟尿嘧啶软膏：它能抑制细胞DNA合成，起到抗病毒作用，不过可能会引起局部刺激，出现红肿、糜烂等情况，使用时要谨慎。
物理治疗手段
冷冻治疗：利用低温使疣体坏死脱落，一般1~2周疣体可脱落，可能需要多次治疗才能完全清除。激光治疗：通过激光的高能量破坏疣体组织，治疗速度较快，单次治疗即可，但术后要注意创面护理，防止感染，且可能会留下轻微疤痕。
免疫调节治疗
干扰素：可调节免疫，抑制病毒复制。常用的有干扰素凝胶等，一般需要连续使用几周，不过起效相对较慢，且可能会有局部刺激症状，如轻度瘙痒、灼痛等。卡介菌多糖核酸：能调节机体免疫功能，增强抵抗力来对抗HPV感染，通常需要多次注射，一般每周2~3次，需连续用一段时间。
中医中药治疗
中药内服：根据辨证论治，比如风热蕴结型可用疏风清热、解毒散结的方剂，如桑菊消疣方等，但具体用药需由医生根据个体情况调配。中药外洗：常用马齿苋、板蓝根、大青叶等中药煎水外洗，有清热解毒、抗病毒的作用，可每天外洗数次，不过外洗时要注意温度，避免烫伤皮肤。