治疗扁平疣最有效的方法如下：
1.物理治疗：包括冷冻、电灼、激光等，可直接去除疣体。医生会根据疣体的大小、数量和位置选择合适的治疗方法。这种方法快速有效，但可能会留下疤痕。
2.外用药物：外用药物包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等。这些药物可以促进疣体的脱落，但需要长期使用，效果因人而异。
3.口服药物：对于疣体较多或病情较重的患者，口服药物可能是一种选择。常用的药物包括抗病毒药物、免疫调节剂等。这些药物需要在医生的指导下使用。
4.中医治疗：中医认为扁平疣是由气血失和、腠理不密导致的，可采用中药调理、针灸等方法进行治疗。中医治疗需要辩证论治，效果因人而异。
5.注意个人卫生：扁平疣是一种传染性疾病，患者应注意个人卫生，避免搔抓疣体，以免造成自身接种。同时，患者使用的毛巾、脸盆等物品应单独使用，并定期消毒。
6.提高免疫力：扁平疣的发生与免疫力下降有关，患者可通过加强锻炼、合理饮食、保持充足睡眠等方式提高免疫力，有助于病情的恢复。
需要注意的是，扁平疣的治疗方法应根据患者的具体情况选择，患者应在医生的指导下进行治疗。同时，患者应避免自行用药或使用偏方，以免加重病情。