肛门瘙痒可能由多种原因引起。一般来说，约有超过半数的肛门瘙痒是由局部因素导致的，比如肛门局部的皮肤病、寄生虫感染等。
局部皮肤因素
肛周湿疹：这是常见原因之一，会出现肛周皮肤红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒。患者往往会不自觉地搔抓，进而加重症状。肛周皮肤真菌感染：比如念珠菌感染，肛周皮肤会有潮红、脱屑等表现，瘙痒明显，尤其在潮湿环境下容易发生。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间蛲虫会爬到肛周产卵，刺激肛周皮肤引起瘙痒，尤其在孩子入睡后1 - 3小时比较明显，可在肛周发现白色细小线虫。疥螨感染：疥螨可在皮肤内挖掘隧道，导致肛周皮肤出现丘疹、水疱，夜间瘙痒加剧，有接触传染的可能。
全身性因素
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤引起瘙痒，同时可能伴有皮肤干燥等表现。肝胆疾病：像黄疸患者，由于胆盐沉积在皮肤，会引起全身皮肤瘙痒，也包括肛周部位，往往瘙痒比较顽固。过敏反应：食用某些过敏食物，或者接触化纤内裤等过敏原，可能引起肛周皮肤过敏，出现瘙痒、皮疹等症状。