月经没完全干净时不可以同房，否则可能会对男女双方造成多种不良影响，以下是具体原因：
女性方面：
细菌感染：月经期间，子宫内膜会有创面形成，且子宫颈口处于扩张状态，此时同房，男性生殖器可能会把细菌带入阴道，经血是细菌等微生物的良好培养基，细菌极易滋生，沿子宫内膜内许多微小伤口和破裂的小血管扩散，感染子宫内膜，甚至可累及输卵管和盆腔器官，从而给女方带来不必要的妇科疾病。
月经不调：经期同房，女性体内激素水平会发生变化，长此以往，会导致月经不调、痛经、闭经等后果。
子宫内膜异位症：如果月经期间同房，脱落的子宫内膜可能逆流进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成子宫内膜异位症，导致女性痛经加剧、性交痛，甚至不孕。
男性方面：
尿道感染：月经期间，女性阴道酸碱度会失衡，此时同房，男性生殖器可能会把细菌带入尿道，从而引发尿道炎。
前列腺炎：如果精液进入女性体内，还可能导致女方盆腔充血，引起男方前列腺不适，甚至诱发前列腺炎。
总之，为了男女双方的身体健康，建议在月经彻底干净2-3天后再同房。如果在月经期间发现任何不适，应及时就医，以免延误病情。