两岁宝宝发烧39度，可采取以下措施：
1.服用退烧药：如对乙酰氨基酚或布洛芬，按照药品说明书的剂量和使用方法给宝宝服用。同时，要注意给宝宝多喝水，以补充水分，防止脱水。
2.物理降温：用温水擦拭宝宝的额头、颈部、腋窝、肘窝、腹股沟等部位，或使用退热贴。但要注意，不要给宝宝用酒精擦拭，以免引起酒精中毒。
3.保持室内通风：保持室内空气流通，温度适宜，但要避免让宝宝直接吹风。
4.观察宝宝的精神状态：如果宝宝发烧的同时伴有精神萎靡、呼吸急促、抽搐等症状，应及时就医。
5.就医：如果宝宝发烧持续不退或出现其他异常症状，应及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。
需要注意的是，以上措施仅适用于一般情况。如果宝宝发烧持续时间较长或出现其他严重症状，应及时就医，并在医生的指导下进行治疗。同时，在给宝宝使用退烧药时，要注意药品的使用剂量和使用时间，避免过量使用。