胃镜检查对身体的伤害较小，一般来说，正规操作下出现严重伤害的概率很低，大约在0.1%以下。但还是有一些需要注意的情况。
检查前的准备可能带来的小不适
禁食要求：检查前通常需要禁食6~8小时，对于一些肠胃功能较弱的人来说，可能会有饥饿感，但这是为了保证胃镜检查时视野清晰，避免食物干扰。比如一些老年人，本身消化功能相对缓慢，严格遵守禁食时间可能会感觉比较明显的饥饿。吞咽管子的感觉：检查时需要将胃镜通过口腔、食管插入胃部，有些人会感觉有恶心、咽部不适的感觉，不过这种感觉一般在检查结束后很快就会消失。
检查过程中可能出现的轻微反应
黏膜轻微擦伤：在胃镜操作过程中，极少数人可能会出现胃黏膜轻微擦伤，不过这种情况非常少见，而且身体自身有修复能力，一般很快就能恢复。比如操作比较熟练的医生进行检查时，发生这种情况的概率极低。短暂的不适感觉：可能会有短暂的腹部胀痛等不适，这是因为胃镜在通过食管、胃时会对周围组织有一定的刺激，但大多都在可耐受范围内。
检查后的注意事项及可能的小影响
咽喉不适：检查后可能会有咽喉部的不适，比如轻微疼痛、异物感等，一般1~2天就会缓解。可以适当喝一些温凉的流质或半流质食物来缓解不适。胃部短暂反应：部分人检查后会有短暂的胃部隐痛、腹胀等，通常休息一段时间或者遵医嘱吃一些保护胃黏膜的药物（仅说明药物通用名，不涉及剂量等服用指导）就能恢复。比如吃一些铝碳酸镁等药物来保护胃黏膜。总体而言，胃镜检查虽然有一些可能出现的小情况，但从整体医疗风险来看，它是一种安全有效的检查手段，能帮助医生准确诊断胃部疾病，其带来的轻微影响相对于它能发现的疾病而言是利大于弊的。