肚脐眼发臭可能是由以下原因引起的：
1.脐炎：脐部凹陷处极易积水、积污，潮湿温暖的环境又给细菌的生长繁殖提供了机会。脐炎轻者表现为局部有脓性分泌物，有臭味，脐部及周围皮肤发红、肿胀；重者会引起腹膜炎，甚至败血症。
2.脐尿管瘘：脐尿管未完全闭合，脐部有管道与膀胱相通，会有尿液从脐部漏出，同时伴有感染时会有臭味。
3.其他：如脐茸、脐息肉等，也会导致肚脐眼发臭。
肚脐眼发臭的治疗方法因病因而异。如果是脐炎，需要进行抗感染治疗，局部消毒，保持脐部干燥。如果是脐尿管瘘或其他疾病，可能需要手术治疗。
患者在治疗期间需要注意保持脐部清洁干燥，避免沾水，不要用手搔抓，以免加重感染。可适当食用富含维生素C、维生素E的食物，如蔬菜、水果等，避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等。
总之，如果肚脐眼发臭，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。