三维超声检查的最佳时间因检查目的不同而有所差异。一般来说，孕期三维超声检查通常在孕22 - 26周进行较好，此时胎儿大小适中，羊水量充足，胎儿在子宫内活动空间较大，有利于清晰显示胎儿各器官结构。
孕期三维超声检查时机
孕早期三维超声：孕11 - 13+6周时，可通过三维超声进行NT（胎儿颈项透明层）检查，能初步筛查胎儿是否有染色体异常等风险。这个阶段的三维超声可以清晰看到胎儿颈部透明带的厚度情况。孕中期三维超声：孕22 - 26周是进行胎儿结构大排畸的较好时期，此时胎儿的主要器官已发育成形，通过三维超声能够较为全面地观察胎儿的头颅、面部、脊柱、心脏、四肢等各部位的形态结构，排查是否存在结构畸形等问题。孕晚期三维超声：孕32 - 36周左右，可再次进行三维超声检查，主要是了解胎儿的生长发育情况、胎位、胎盘位置、羊水情况等，为分娩做准备。
妇科三维超声检查时机
常规妇科三维超声：一般在月经干净后的3 - 7天进行较为合适，这个时期子宫内膜较薄，能更清晰地观察子宫、卵巢等盆腔器官的形态、结构，减少宫腔内残留血液等对检查的干扰。怀疑妇科疾病时：如果怀疑有子宫肌瘤、卵巢囊肿等疾病，检查时间则不受月经周期限制，可随时进行检查，以便及时发现病变情况。
其他部位三维超声检查时机
乳腺三维超声：对于乳腺检查，一般在月经结束后1周左右进行较好，此时乳腺组织相对处于静止状态，受体内激素影响较小，检查结果更准确。如果是怀疑乳腺有恶性病变等情况，可随时进行检查。甲状腺三维超声：甲状腺三维超声检查时间没有严格的月经周期限制，可根据病情随时进行，能清晰显示甲状腺的形态、大小、结构以及血流情况等，辅助诊断甲状腺相关疾病。