双侧乳腺内多发性囊肿的治疗方法主要有以下几种：
1.定期复查：如果囊肿较小，没有明显症状，一般不需要特殊治疗，定期复查即可，通常建议每3~6个月复查一次乳腺超声，以监测囊肿的变化情况。
2.药物治疗：如果囊肿引起了疼痛等不适症状，可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如逍遥丸、乳癖消等，以缓解症状。
3.手术治疗：如果囊肿较大，或经过一段时间的观察，囊肿体积持续增大，或出现了恶变的倾向，一般需要进行手术治疗，手术方式包括囊肿切除术、乳腺区段切除术等。
4.中医治疗：中医认为乳腺内多发性囊肿与肝郁气滞、痰凝血瘀等有关，可以采用中药、针灸、按摩等方法进行治疗，以调理气血、化痰散结。
需要注意的是，双侧乳腺内多发性囊肿的治疗方法应根据患者的具体情况进行选择，如囊肿的大小、位置、症状、年龄、生育需求等。在治疗过程中，患者应遵医嘱定期复查，以便及时调整治疗方案。此外，患者还应保持良好的生活习惯，如保持心情愉悦、避免熬夜、合理饮食等，有助于促进病情的恢复。