子宫隐隐作痛可能由多种原因引起。比如女性在生理期时，约有10% - 20%的人会有下腹不适，其中部分人会感觉子宫隐隐作痛，这多与前列腺素分泌有关，前列腺素增多会引起子宫平滑肌收缩和血管痉挛，导致疼痛。
生理期相关原因
子宫内膜前列腺素水平： 女性生理期时，子宫内膜会合成较多前列腺素，尤其是前列腺素F2α和前列腺素E2，它们会让子宫肌层过强收缩、血管痉挛，从而引发子宫隐隐作痛。一般这种疼痛在月经来潮前1 - 2天开始出现，经期第1天最严重，之后逐渐缓解。子宫收缩异常： 生理期时子宫收缩如果不协调，也会导致子宫隐隐作痛。比如子宫收缩过强或过弱，都可能引起不适。
妊娠相关原因
先兆流产： 怀孕早期出现子宫隐隐作痛，可能是先兆流产的表现。如果孕妇体内孕激素水平不足，或者胚胎本身有问题，就可能引起子宫收缩，出现下腹隐痛，还可能伴有少量阴道流血。一般怀孕前3个月发生概率相对高些。宫外孕： 宫外孕时，受精卵着床在子宫以外的部位，常见在输卵管，随着胚胎生长，会引起输卵管膨胀、破裂等，导致一侧下腹部隐痛或酸胀感，若输卵管破裂，会出现剧烈腹痛和大量出血。
妇科疾病相关原因
盆腔炎： 女性盆腔内的器官发生炎症，如子宫、输卵管、卵巢等发炎时，会引起子宫隐隐作痛。盆腔炎多由细菌感染引起，常见于有性生活的女性，尤其是性生活活跃的年轻女性。炎症会导致盆腔充血、组织粘连，从而出现下腹部坠胀、疼痛，还可能伴有白带增多、异味等症状。子宫内膜异位症： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，就叫子宫内膜异位症。异位的内膜会随着生理期出血，刺激周围组织，引起子宫隐隐作痛，疼痛多在经期出现，还可能会影响生育，这种病在育龄女性中较为常见。