肛门发痒可能由多种原因引起，比如约有60%的肛门瘙痒是由局部因素导致的。
局部皮肤病变引起
肛周湿疹：这是常见原因之一，多与过敏、潮湿等有关。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能糜烂、渗出。一般病程较长，容易反复发作。痔疮：尤其是外痔，痔核脱出后可能刺激肛周皮肤，导致分泌物增多，进而引起肛门发痒。如果痔疮出现炎症水肿，瘙痒会更明显。
寄生虫感染导致
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其在夜间更甚。可以在夜间肛门周围发现白色细小的线虫。蛔虫等肠道寄生虫：虽然主要是肠道内感染，但有时也可能导致肛周瘙痒，不过相对蛲虫感染来说，这种情况相对少见。
肛门直肠疾病引发
肛瘘：肛瘘外口会持续流出少量脓性、血性、黏液性分泌物，这些分泌物刺激肛周皮肤，就会引起肛门发痒，有时还会伴有肛周潮湿、肿痛等症状。肛裂：肛裂患者排便时会疼痛，同时创面会分泌炎性物质，刺激肛门周围皮肤，导致肛门发痒。而且肛裂愈合缓慢，瘙痒可能会持续存在。
全身性疾病相关
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，容易引发肛门发痒。同时还可能伴有多饮、多食、多尿、体重减轻等症状。肝胆疾病：如黄疸患者，由于血液中胆盐含量升高，会刺激神经末梢，导致全身皮肤瘙痒，肛门周围也不例外。