乳腺囊性增生的主要治疗方法是药物治疗和手术治疗，具体治疗方案应根据患者的年龄、症状、病变轻重等因素决定。
乳腺囊性增生是一种既非炎症又非肿瘤的疾病，与内分泌功能紊乱密切相关。其主要病因是卵巢功能失调，黄体素分泌减少，雌激素分泌过多，导致乳腺实质增生过度和复旧不全，经过一段时间后，增生的乳腺实质不能完全消退，就形成乳腺囊性增生。患者可出现乳房疼痛和乳腺摸到结节等症状，少数患者还会有乳头溢液。
如果患者仅有轻度乳房疼痛而无明显肿块，可采用心理治疗、中医中药治疗等方法缓解疼痛，调整卵巢功能。如果患者有乳房疼痛且影响到日常生活，或乳房内有肿块，就需要进行药物治疗，以活血化瘀、软坚散结为主，常用药物有小金丸、乳癖消、逍遥散等。如果患者的病情比较严重，或药物治疗无效，还可考虑手术治疗，以切除局部增生腺体组织。