免疫科主要诊治与免疫系统相关的疾病，涵盖多种自身免疫性疾病、免疫缺陷病等。
自身免疫性疾病
自身免疫性疾病是免疫系统错误攻击自身组织器官引发的病症。例如类风湿关节炎，主要累及关节，导致关节肿胀、疼痛、畸形，多见于中老年人，女性发病相对较多，常因长期劳累、受寒等因素诱发，会严重影响关节功能和生活质量。
免疫缺陷病
免疫缺陷病是免疫系统发育不全或遭受损害等原因导致免疫功能缺陷的疾病。原发性免疫缺陷病多与遗传有关，患儿自幼年起就易反复感染，如反复呼吸道感染、消化道感染等，严重影响生长发育，生活中需格外注意防护，避免接触感染源。
变态反应性疾病（过敏相关疾病）
变态反应性疾病是机体接触过敏原后发生异常免疫反应引起的疾病。常见的有过敏性鼻炎，患者会出现鼻痒、打喷嚏、流涕等症状，在花粉传播季节等易发作，严重影响日常工作和生活，不同年龄人群都可能患病，与个人过敏体质及接触过敏原情况有关。
其他免疫相关疾病
还有一些其他与免疫相关的疾病也在免疫科诊治范畴，比如某些血管炎，可累及血管，导致血管炎症、狭窄等，影响相应组织器官的血液供应，不同年龄段均可发病，病因较为复杂，可能与感染、自身免疫等多种因素相关。