小便时小腹疼痛可能是膀胱炎、尿道炎、前列腺炎、前列腺增生、膀胱结石、尿道结石等原因所致，可以通过尿常规、超声等检查明确原因，针对病因进行治疗。具体分析如下：
1.膀胱炎：膀胱发生炎症时，炎症刺激可导致小便时小腹疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。治疗上主要是使用抗生素进行抗感染治疗，如左氧氟沙星、头孢呋辛酯等。同时，患者需要注意休息，多喝水，勤排尿。
2.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，也会出现小便时小腹疼痛，还可能伴有尿道口红肿、分泌物增多等症状。治疗方法与膀胱炎相似，主要是使用抗生素进行抗感染治疗。此外，患者还需要注意尿道口的清洁卫生，避免不洁性行为。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病，可分为急性前列腺炎和慢性前列腺炎。前列腺炎患者在排尿时，会出现小腹疼痛、会阴不适等症状。治疗前列腺炎的方法有很多，如药物治疗、物理治疗、手术治疗等，需要根据患者的具体情况选择合适的治疗方法。
4.前列腺增生：前列腺增生是老年男性常见的疾病，增生的前列腺会压迫尿道，导致排尿困难，也会出现小便时小腹疼痛的症状。治疗前列腺增生的方法主要有药物治疗和手术治疗，药物治疗常用的有坦索罗辛、非那雄胺等，手术治疗则包括经尿道前列腺电切术、经尿道前列腺切开术等。
5.膀胱结石：膀胱结石也会导致小便时小腹疼痛，结石还可能堵塞尿道口，导致排尿困难。治疗膀胱结石的方法主要有体外冲击波碎石、经尿道膀胱镜取石术等。
6.尿道结石：尿道结石会嵌顿在尿道，导致排尿困难和疼痛，疼痛通常位于尿道口和阴茎头部。治疗尿道结石的方法主要有尿道探子取石、尿道切开取石等。
患者在治疗期间需要注意休息，避免过度劳累和久坐，同时要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物。此外，患者还需要注意个人卫生，勤换内裤，保持会阴部清洁干燥。