怀孕三个月流产是会疼的，这种疼痛的程度因人而异，有些女性可能会感觉到比较剧烈的疼痛，而有些女性可能只会感觉到轻微的不适。
在怀孕三个月时，胎儿已经开始形成人形，此时进行流产手术需要通过刮宫或引产的方式来终止妊娠。这些操作会对子宫壁和子宫颈造成一定的刺激和损伤，从而引起疼痛。
此外，流产手术还可能伴随着其他不适症状，如恶心、呕吐、头晕、乏力等。这些症状的出现也会让女性感到痛苦和不适。
需要注意的是，对于怀孕三个月的女性来说，流产手术是一种较为复杂的医疗操作，需要在专业医生的指导下进行。在手术前，医生会对女性的身体状况进行全面评估，并根据评估结果制定个性化的手术方案。同时，女性在手术后也需要注意休息和护理，避免感染和其他并发症的发生。
总之，怀孕三个月流产是会疼的，但是这种疼痛是可以通过药物和技术手段来缓解的。如果女性需要进行流产手术，建议及时就医，并在医生的指导下进行手术和护理。