指甲凹凸不平可能是营养不良、真菌感染、扁平苔藓、银屑病等原因所致，可以通过调整饮食、药物治疗、物理治疗等方式进行改善，建议及时就医。具体分析如下：
1.营养不良：长期饮食不规律、挑食、节食等，可能会导致体内缺乏维生素、蛋白质等营养物质，从而引起指甲凹凸不平。患者可以通过调整饮食结构，多吃一些富含维生素、蛋白质的食物，如蔬菜、水果、鸡蛋、牛奶等，同时还可以遵医嘱服用多维元素片、维生素D滴剂等药物进行治疗。
2.真菌感染：指甲受到真菌感染，可出现指甲增厚、变色、凹凸不平等症状。患者可在医生的指导下使用抗真菌药物进行治疗，如盐酸特比萘芬乳膏、酮康唑乳膏等。如果指甲受损严重，还需要通过拔甲治疗来改善症状。
3.扁平苔藓：扁平苔藓是一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病，可累及皮肤、指甲等部位，导致指甲出现纵行、横行的隆起，甲板也会变得粗糙、凹凸不平。患者可在医生的指导下使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物进行治疗，如泼尼松龙片、他克莫司软膏等。
4.银屑病：银屑病可导致指甲出现顶针样凹陷，甲板也会失去光泽，变得肥厚、易碎，还可能出现纵嵴、横沟、甲剥离等症状。患者可在医生的指导下使用卡泊三醇软膏、他卡西醇软膏等药物进行治疗，也可使用光疗、浴疗等方法进行辅助治疗。
患者在治疗期间需要注意保持指甲清洁卫生，避免接触刺激性物质，如碱性肥皂、洗衣粉等。同时，还可适当食用一些富含蛋白质、维生素的食物，如鸡蛋、牛奶、苹果、橙子等，以促进指甲的恢复。