一岁多宝宝高烧39°C可能是感染、免疫系统问题、疫苗反应、其他潜在健康问题等原因所致，可以通过物理降温、药物治疗的方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.感染：是导致宝宝发烧最常见的原因之一，如感冒、喉咙痛、肺炎等。
2.免疫系统问题：宝宝的免疫系统可能还不够成熟，容易出现自身免疫性疾病或过敏反应，导致发烧。
3.疫苗反应：有些疫苗接种后可能会引起短暂的发烧反应。
4.其他潜在健康问题：如川崎病、幼年特发性关节炎、血液疾病等也可能导致宝宝发烧。
患者在治疗期间需要注意保持宝宝的水分摄入，可适当食用富含维生素C、水分的食物，如橙子、苹果、梨等，避免食用辛辣、油腻、刺激性的食物，如辣椒、油炸食品、冷饮等。