怀孕孕酮低的原因主要有以下几点：
1.黄体功能不全：怀孕后，黄体分泌孕酮维持妊娠。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就会导致孕酮低。
2.肾上腺、甲状腺功能失调：肾上腺、甲状腺功能严重失调，会影响卵巢功能，导致孕酮含量降低。
3.胚胎发育异常：如果胚胎发育异常，如染色体异常，也会导致孕酮低。
4.孕妇自身疾病：孕妇患有某些疾病，如糖尿病、高血压、自身免疫性疾病等，也可能影响孕酮的代谢，导致孕酮低。
5.其他因素：如压力过大、情绪波动、环境变化等，也可能影响孕酮的分泌。
需要注意的是，孕酮低并不一定意味着一定会流产，但可能会增加流产的风险。如果怀孕后发现孕酮低，需要及时就医，医生会根据具体情况采取相应的治疗措施，如补充孕酮、卧床休息、定期复查等。同时，孕妇也要注意休息，保持良好的心态，避免过度劳累和紧张。