一、黄体功能不全
黄体是排卵后由卵泡迅速转变成的富有血管的腺体样结构，其主要功能是分泌孕酮。若黄体功能不全，就会导致孕激素分泌量不足，这是怀孕早期孕酮低的常见原因之一。正常排卵周期中，黄体期孕激素水平会升高以支持早期妊娠，如果黄体发育不良，就无法产生足够的孕酮来维持妊娠所需的激素环境。
二、胚胎因素
胚胎染色体异常是导致孕酮低的重要原因。当胚胎存在染色体数目或结构异常时，会影响滋养细胞的正常功能，而滋养细胞是分泌孕酮的重要细胞，因此胚胎异常可能引发孕酮水平降低。这种情况下，胚胎往往难以正常发育，可能会出现自然流产等不良妊娠结局。
三、内分泌疾病影响
1.甲状腺功能减退：甲状腺分泌的激素参与机体多种代谢调节，甲状腺功能减退时，机体内分泌系统的平衡被打破，可能影响到孕激素的合成与分泌，从而导致孕酮水平降低。甲状腺功能减退还可能对胎儿的生长发育产生不利影响，如影响胎儿神经系统发育等。
2.高泌乳素血症：过高的泌乳素水平会干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的正常功能，进而影响黄体的功能，导致孕酮分泌减少。高泌乳素血症可能由垂体疾病等多种原因引起。
四、其他因素
1.生活方式因素：长期熬夜、过度劳累等不良生活方式可能影响内分泌系统的正常调节，从而干扰孕酮的分泌。此外，吸烟、酗酒等不良习惯也可能对激素水平产生负面影响，增加孕酮低的风险。
2.母体自身慢性疾病：如患有糖尿病等慢性疾病时，机体的代谢紊乱可能波及激素的合成与代谢过程，导致孕酮水平异常。糖尿病患者血糖控制不佳时，会影响相关内分泌激素的平衡，进而影响孕酮的分泌情况。