喝牛奶后肚子疼可能是多种原因导致的，比如乳糖不耐受、对牛奶蛋白过敏等，一般短时间内就会出现不适反应。
一、乳糖不耐受导致肚子疼
人体缺乏乳糖酶时，无法完全消化牛奶中的乳糖，未被消化的乳糖在肠道内被细菌分解发酵，产生气体等刺激肠道，就会引发肚子疼，常伴有腹胀、腹泻等症状，多在饮用牛奶后30分钟至2小时内出现。儿童因消化系统发育不完善，更易发生乳糖不耐受；成年人随着年龄增长，乳糖酶活性也可能下降。
二、牛奶蛋白过敏引起肚子疼
这是机体对牛奶中的蛋白质产生的异常免疫反应，除了肚子疼，还可能出现呕吐、皮疹、腹泻等症状，过敏反应出现时间不一，有的即刻发生，有的可能数小时后出现。婴幼儿免疫系统尚不成熟，相对更易发生牛奶蛋白过敏；有家族过敏史的人群发生概率可能更高。
三、肠道敏感导致肚子疼
本身肠道较为敏感的人，饮用牛奶后，牛奶中的成分可能刺激肠道，引起肠道痉挛等，从而出现肚子疼情况。生活方式不规律、长期精神紧张的人肠道敏感性可能更高；患有肠道基础疾病的人也可能因牛奶刺激加重肠道不适。
四、其他原因导致肚子疼
如饮用了变质的牛奶，其中的细菌等有害物质会刺激肠道，引发肚子疼。此外，一次性饮用大量牛奶也可能超出肠道的消化承受能力，导致肚子疼。