皮肤上长小肉疙瘩的原因有很多，以下是一些常见的原因：
皮肤纤维瘤：这是一种良性肿瘤，通常由皮肤纤维组织过度增生引起。皮肤纤维瘤好发于中青年，女性多于男性。损害为圆形或卵圆形的坚实结节，表面光滑或粗糙，呈淡红色或正常肤色，直径一般为1～2cm，可逐渐增至数厘米。质地硬，可推动，数目不定，有的可自行消退。好发于躯干和四肢近端。一般不需要治疗，如果影响美观或怀疑恶变，可以手术切除。
丝状疣：这是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起的一种传染性皮肤病。丝状疣主要侵犯青少年，好发于颈项、眼睑、额部和头皮等部位。表现为单个细软的丝状突起，呈正常肤色或棕灰色。一般无自觉症状，若发生于眼睑，可伴发结膜炎或角膜炎。丝状疣可通过直接接触传染，搔抓会导致自身接种传染。可以通过激光、冷冻、电灼等方法去除疣体。
扁平疣：这也是由HPV感染引起的一种病毒性皮肤病。扁平疣主要侵犯青少年，可通过直接或间接接触传染。好发于颜面、手背及前臂。表现为米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑，质地硬，正常肤色或淡褐色，多骤然出现，数目较多且密集，搔抓后皮损可呈串珠状排列（称同形反应）。一般无自觉症状或偶有微痒。扁平疣可自行消退，也可通过外用药物、物理治疗（如激光、冷冻、电灼等）或系统治疗（如抗病毒药物、免疫调节剂等）去除疣体。
传染性软疣：这是由传染性软疣病毒（MCV）感染引起的一种传染性皮肤病。传染性软疣的主要传播途径是直接接触传染，也可通过性接触传染。儿童和青年人好发。典型损害为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出乳酪样软疣小体。治疗主要是去除疣体，可在无菌条件下用齿镊或弯曲血管钳将软疣小体挤出，然后涂以2.5%碘酊或0.5%酞丁安霜等。
如果皮肤上长了小肉疙瘩，建议及时就医，明确诊断，并根据医生的建议进行治疗。同时，要注意个人卫生，避免搔抓患处，以防传染。