碘-131治疗常见的副作用包括甲状腺功能减退，据统计，在碘-131治疗后的1年内，约有5%~30%的患者会出现永久性甲状腺功能减退，需要长期服用甲状腺激素替代治疗。
甲状腺功能减退相关表现
短期可能出现的情况：治疗后数周内，部分患者可能会有乏力、怕冷、嗜睡等轻微甲状腺功能减退迹象，但一般较轻微。长期影响：若发展为永久性甲状腺功能减退，患者需要终身服用左甲状腺素钠片来维持甲状腺激素水平，且要定期复查甲状腺功能，调整药物剂量。
放射性唾液腺炎
症状表现：治疗后1~3天内，可能出现唾液腺肿胀、疼痛，尤其是腮腺部位，影响进食和吞咽。应对方法：可以通过多喝水来缓解，一般在1~2周内可逐渐恢复，严重时可在医生指导下进行对症处理。
辐射性甲状腺炎
发生时间：通常在治疗后1周左右出现，患者会感觉颈部甲状腺区域疼痛、压痛。严重程度：多数为轻度至中度疼痛，一般可以通过休息、服用非甾体抗炎药（如布洛芬等，但需遵医嘱使用，避免自行用药）来缓解疼痛，少数严重的可能需要进一步治疗。
对生育功能的潜在影响
对女性的影响：女性患者在接受碘-131治疗后，短期内可能会影响月经周期，一般治疗后3~6个月可逐渐恢复，但也有个别患者可能会出现卵巢功能暂时受影响的情况，不过这种情况较为少见，且多数可恢复。对男性的影响：男性患者可能会出现精子质量暂时下降的情况，一般在治疗后3~6个月可逐渐恢复正常精子质量，但也需要定期监测精子情况。